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94 人阅读发布时间:2025-09-01 11:29
该方案描述了基于SPRI 技术(固相载体可逆固定化)的 AMPure XP 试剂,应用于96和384孔板PCR产物纯化(提纯)操作步骤。该试剂利用经优化缓冲液将超顺磁珠选择性地与100 bp 及更大的 DNA 片段结合,并通过简便的洗涤步骤有效去除多余 dNTP、引物、引物二聚体、盐离子和其他杂质。
注意: 尽管其他机构组织已使用AMPure XP磁珠试剂开发了片段大小筛选方案,但我们无法确保试剂性能或是否支持此类应用。我们推荐您使用专为片段大小筛选而开发的 SPRIselect 试剂。希望了解更多关于AMPure XP和SPRIselect试剂之间的区别吗?请点击访问此页面。
确定样品是否需进行板转移。
如果PCR反应体积和2.8系数的乘积超过PCR板体积,则需将样品转移至300 μL圆底板或1.2 mL深孔板。
振摇AMPureXP试剂瓶,以重悬任何可能已经沉降的磁珠颗粒。然后根据表中所示样品的反应体积添加AMPure XP试剂:
| 样品反应体积 (μL) | AMPure XP 体积 (μL) |
| 10 | 18 |
| 20 | 36 |
| 50 | 90 |
| 100 | 180 |
AMPure XP试剂加入体积可由以下公式计算得出:
(每次加入的 AMPure XP 体积) = 1.8 x (反应体积)
该步骤中,100 bp 或更大的 DNA 片段将与磁珠结合。相比涡旋,移液器混合效果更佳,因为其结果更具可重复性。充分混匀后,混合物的颜色应呈均相状态:
—通过移液器吸头反复吹打10次,确保试剂和样品充分混匀。将混匀样品置于室温下孵育5分钟,以获得最大回收率。
将反应板置于 SPRIPlate 96孔环形超级磁力板 上2分钟,将磁珠从溶液中分离。
重要提示: 待溶液澄清后,再继续下一步操作。
当反应板置于SPRIPlate 96孔环形超级磁力板上时,执行以下步骤:
—从反应板中吸取上清液并废弃。保留 5 μL 上清液,以避免磁珠会与上清液一同被吸出。
重要提示: 请勿扰动磁珠。
重要提示: 当反应板仍置于SPRIPlate 96孔环形超级磁力板上时,执行以下步骤。注意不要扰动磁珠。另外,请务必彻底清洗孔底,以完全清除所有残留乙醇。
将 200 μL 70% 乙醇分装至反应板的每个孔,并置于室温下孵育 30 秒。吸取乙醇并废弃。
注意: 如果样品加试剂的总体积超 200 μL,则洗涤样品的体积应至少为200μL。
重复洗涤步骤两次。
磁珠在乙醇中不易被吸取,因此无需保留上清液。
注意: 为确保完全去除所有乙醇,可以增加磁珠干燥时间。对于 10 kb 或更大的产物片段,请勿过度干燥磁珠(若干燥过度,磁珠会出现裂痕),从而大幅降低洗脱效率。
从磁力板上取出反应板,然后向反应板的每个孔中加入 40 μL 洗脱缓冲液,使用移液器混匀 10 次。孵育 2 分钟。
液位需足够高,为使40 μL洗脱液完全浸没磁珠,可适当增加洗脱缓冲液体积。但若使用小于40 μL的洗脱缓冲液则需额外的混匀步骤(以确保液体与磁珠充分接触),另外还可能降低PCR产物的洗脱率。
将反应板置于SPRIPlate 96孔环形超级磁力板上1分钟,将磁珠从溶液中分离。
将洗脱液转移至新板。
注意:通常无需担心磁珠转移到目标板中。可将样品与磁珠一同储存至冰箱,磁珠在下游的酶促反应中呈惰性。如果出于任何原因需限制磁珠残留,则可在母板中保留 2 μL – 5 μL 洗脱液。此外,可以将包含磁珠的溶液在磁力架上进行二次分离。为此,将含有磁珠的最终板放在磁力板上洗脱 1 分钟以分离磁珠。将洗脱液转移至另一块块干净的板。
384孔操作步骤振摇AMPureXP试剂瓶,以重悬任何可能已经沉降的磁珠颗粒。然后根据下表所示样品反应体积加入AMPure XP试剂。
注意: 无法在384孔PCR板的孔内纯化大于14μL的反应体积,因为样品加试剂的总体积大于该体积,如下式所示:
(14 μL 样品反应体积 n + 25 μL AMPure XP = 39 μL)
| 样品反应体积 (μL) | AMPure XP体积e (μL) |
| 5 | 9 |
| 7 | 12.6 |
| 10 | 18 |
| 14 | 25 |
AMPure XP试剂加入体积可由以下公式计算得出:
(每次加入的 AMPure XP 体积) = 1.8 x (反应体积)
该步骤中,100 bp 或更大的 DNA 片段将与磁珠结合。相比涡旋,移液器混合效果更佳,因为其结果更具可重复性。充分混匀后,混合物的颜色应呈均相状态:
—使用移液器吸头反复吹打10次,使试剂和样品充分混匀。将混匀样品置于室温下孵育5分钟,以获得最大回收率。
将反应板置于 SPRIPlate 384 孔板磁力架 上 2 分钟,将磁珠从溶液中分离。
重要提示: 待溶液澄清后,再进行下一步操作。
当反应板置于 SPRIPlate 384 Post Magnet Plate上时,需执行以下步骤:
—从反应板中吸取上清液并废弃。保留 5 μL 上清液,以避免磁珠会与上清液一同被吸出。
重要提示: 待溶液澄清后,再进行下一步操作。
重要提示: 当反应板仍置于SPRIPlate 384 Post Magnet Plate上时,执行以下步骤。注意不要扰动磁珠。另外,请务必彻底清洗孔底,以完全清除所有残留乙醇。
将 30 μL 70% 的乙醇洗涤溶液加入至反应板的每个孔中,并置于室温下孵育 30 秒。吸出乙醇并废弃。
注意: 如果样品加试剂的总体积超 200 μL,则洗涤样品的体积应至少为200μL。
重复两次洗涤步骤。
磁珠在乙醇中不易被吸取,因此无需保留上清液。
注意: 为确保完全去除所有乙醇,可适当延长磁珠干燥时间。对于 10 kb 或更大的产物片段,请勿过度干燥磁珠(若干燥过度,磁珠会出现裂痕),从而大幅降低洗脱效率。
从磁力板上取出反应板,然后向每个孔中加入 30 μL 洗脱缓冲液,使用移液器吸头反复吹打 10 次,确保充分混合。孵育 2 分钟。
添加30 μL 洗脱液,确保液位足以完全接触磁珠。可增加洗脱缓冲液体积,但使用小于 15 μL的洗脱缓冲液时需额外进行混合步骤(以确保液体与磁珠充分接触),且可能导致无法完全洗脱所有产物。
将反应板置于 SPRIPlate 384 Post Magnet Plate上 1 分钟,将磁珠从溶液中分离。
将洗脱液转移至新板。
注意: 通常无需担心磁珠转移到目标板中。可将样品与磁珠一同储存至冰箱,磁珠在下游的酶促反应中呈惰性。如果出于任何原因需限制磁珠残留,则可在母板中保留 2 μL – 5 μL 洗脱液。此外,可以将含有磁珠的溶液在磁力架上进行二次分离。为此,将含有磁珠的最终板放在磁力板上洗脱 1 分钟以分离磁珠。将洗脱液转移至另一块干净的板。